导语: 2023年4月,思路迪诊断推出结直肠癌MRD专属动态监测升级版——肠思微TM。该升级版MRD检测:检测下限达十万分之6.25,灵敏度高达98.08%,特异度100%;样本平均测序深度>100,000X,结合多维降噪方案,保证ctDNA低频检测的准确性;约98.1%的中国结直肠癌患者可检测出突变;术前血检出率高达90.48%,临床队列术后第一次采血预测复发灵敏度高达61.04%。本期重点谈 “精”——检测下限达十万分之6.25。
MRD检测的评价指标
CSCO结直肠癌诊疗指南、NCCN结肠癌诊疗指南虽提及ctDNA在肠癌的临床应用价值及各类检测技术的优缺点,但针对结直肠癌ctDNA-MRD检测的具体规范及标准并未详细阐述。
吴一龙教授在其肺癌MRD检测的相关文章中提到:对于基于下一代测序技术(Next-generation sequencing, NGS) ctDNA-MRD分析,跟踪的突变数量、测序深度和建库DNA量会影响检测下限(limit of detection, LoD)。LoD客观反映了ctDNA-MRD检测技术能够稳定检出的ctDNA丰度水平[1],以下为文章中举例的部分MRD检测相关参数。
在特定突变丰度(Variant Allel Frequency, VAF)下,又有多个性能指标进行评价,如:灵敏度(Sensitivity)、特异度(specificity)、阳性预测值(positive predictive value, PPV)、阴性预测值(negative predictive value, NPV)。
灵敏度=真阳性/(真阳性+假阴性),即真阳性样本中判断为阳性的概率。
特异度=真阴性/(假阳性+真阴性),即真阴性样本中判断为阴性的概率。
阳性预测值=真阳性/(真阳性+假阳性),即判断为阳性中真相性样本的概率。
阴性预测值=真阴性/(假阴性+真阴性),即判断为阴性中真阴性样本的概率。
检测下限达十万分之6.25
《肿瘤相关突变基因检测试剂(高通量测序法)性能评价通用注册技术审查指导原则》指出:LoD是采用分析物最低浓度计算得出,在此浓度下,可从相应检测重复中获得至少95%的阳性检出和可接受水平的无应答或无效应答。
思路迪诊断推出的结直肠癌MRD专属动态监测升级版——肠思微TM:
·精选结直肠癌134个高频变异基因及其位点,样本平均测序深度>100,000X。
·建库DNA量≥20ng时,检测下限十万分之6.25。
·灵敏度高达98.08%,特异度100%,阳性预测值100%,阴性预测值99.98%。
参考文献
[1] Zhang, J-T, Zhong, W-Z, Wu, Y-L. Molecular residual disease: A new clue for individualized approach in non-small cell lung cancer. Med Adv. 2023; 1– 10. https://doi.org/10.1002/med4.11